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【课程】微生物比较基因组精品系列课

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《【课程】微生物比较基因组精品系列课》课程

第一章：微生物比较基因组学研究方案

1、 比较基因组学导论

1:31:27
2、 微生物基因组组装和质粒组装常见问题及解决方案（上）

00:46:36
3、 微生物基因组组装和质粒组装常见问题及解决方案（下）

00:29:28
4、 微生物基因家族研究方法

00:30:19
5、 微生物泛基因组学研究方法和同源基因分析

1:09:45

第二章：Linux系统入门：常用命令和软件使用方法

1、 Linux系统入门导言

00:14:29
2、 Linux系统中9个常见命令和使用规则
附件:

00:48:38
3、 Linux系统中如何压缩和解压缩文件

00:12:37
4、 扩展--Linux系统中5个文件处理命令

00:21:40
5、 如何在Linux系统中安装软件和添加环境变量

00:19:24
6、 综合性实战--如何快速搜索和导出特定基因序列

00:06:28

第三章：比较基因组分析软件实操

1、 如何通过BLAST软件做比较基因组学分析1
附件:

00:37:09
2、 如何通过BLAST软件做比较基因组学分析2

00:16:40
3、 同源基因分析方法概论

00:17:44
4、 使用OrthoFinder软件做同源基因分析实操课
附件:

00:22:57
5、 基于单拷贝同源基因构建物种进化树实操课

00:16:57
6、 使用Mauve软件做基因组共线性分析实操课
附件:

1:17:45
7、 如何使用BRIG绘制比较基因组圈图？
附件:

00:28:11
8、 BRIG绘图高级使用和常见问题

00:54:30
9、 使用EasyFig软件绘制比较基因簇实操课
附件:

00:29:49

第四章：微生物基因组重测序分析实操

1、 微生物重测序研究理论知识串讲

00:13:20
2、 使用Snippy软件
附件:

00:21:30
3、 使用Mauve软件基于组装结果找SNP实操课
附件:

00:28:05

第五章：全基因组层面的进化树构建和美化实操

1、 使用kSNP3软件基于组装结果找SNP
附件:

00:19:44
2、 使用iTOL平台美化进化树实操
附件:

1:28:48
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