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背景知识：肺炎克雷伯菌(Klebsiellapneumoniae)属于肠杆菌科，其中包括沙门氏菌属（Salmonella）和埃希氏菌属（Escherichia）。肺炎克雷伯菌是世界上最常见的医院病原体之一，也是新生儿败血症的主要原因。世界卫生组织认识到产生广谱β-内酰胺（ESBL）和耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌（CRKp）是一种严重的公共卫生威胁。据报道唯那生物 2023-01-06 15:17:15 3807 点赞 收藏
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文章题目：APseudomonasT6SSeffectorrecruitsPQS-containingoutermembranevesiclesforironacquisition文章链接：https://doi.org/10.1038/ncomms14888发表时间：2017.03期刊：Naturecommunications影响因子：14.7研究概述这篇论文研究了铜绿假单胞菌（Pseudomonasaeruginosa）的铁获取机制。研究发现，该菌种存在一种新的铁看不见的线 2025-03-28 08:23:18 40 点赞 收藏
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课程链接【课程】微生物抗性与毒力基因注释：ABRicate软件全能实战【课程】肺炎克雷伯菌耐药研究方法及分析思路【课程】铜绿假单胞菌耐药性研究与分析实战看不见的线 2025-03-27 08:29:09 62 点赞 收藏
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文章题目：Understandingbacterialecologytocombatantibioticresistancedissemination文章链接：doi:10.1016/j.tibtech.2024.12.011发表时间：2025.01期刊：Trendsinbiotechnology影响因子：14.3引言环境来源的抗生素耐药性传播日益受到关注。尽管抗生素耐药性传播事件广泛发生，但生态系统中实际上存在多种障碍，限制了细看不见的线 2025-03-25 09:05:41 79 点赞 收藏
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课程链接【课程】微生物抗性与毒力基因注释：ABRicate软件全能实战【课程】肺炎克雷伯菌耐药研究方法及分析思路【课程】铜绿假单胞菌耐药性研究与分析实战看不见的线 2025-03-24 08:27:13 81 点赞 收藏
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课程链接【课程】微生物抗性与毒力基因注释：ABRicate软件全能实战【课程】肺炎克雷伯菌耐药研究方法及分析思路【课程】铜绿假单胞菌耐药性研究与分析实战看不见的线 2025-03-20 08:20:56 142 点赞 收藏
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随着基因组学研究的深入，细菌基因组注释成为了重要的一步。Bakta（BacterialGenomeAnnotationToolkit）是一款高效的细菌基因组注释软件，它能够自动化完成基因预测、功能注释以及其他相关的生物信息学分析。本文将带您了解Bakta的安装、使用及结果解读。一、Bakta简介Bakta是一款专为细菌基因组设计的注释工具，主要应用于看不见的线 2025-03-18 08:30:01 221 点赞 收藏
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课程链接【课程】可移动元件研究实战指南——从理论机制到分析实操【课程】铜绿假单胞菌基因组研究综合分析实战看不见的线 2025-03-17 08:19:52 143 点赞 收藏
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课程链接【课程】可移动元件研究实战指南——从理论机制到分析实操【课程】肺炎克雷伯菌基因组学研究综合指南【课程】铜绿假单胞菌基因组研究综合分析实战看不见的线 2025-03-14 08:39:41 193 点赞 收藏
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暂无简介看不见的线 2025-03-12 09:35:58 197 点赞 收藏
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文章标题：High-copyIncP-2megaplasmidcarryingblaAFMinclinicaldifficult-to-treatresistancePseudomonasaeruginosa:Associatedwithhigh-levelcefiderocolresistance发表时间：2025.2发表期刊：TheJournalofinfectionDOI：10.1016/j.cmi.2024.01.014IF：14.3概述本研究首次在临床碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌（CRPA）中发现了看不见的线 2025-03-11 08:22:17 329 点赞 收藏
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课程链接【课程】R语言入门与高通量测序数据实战处理【课程】R语言实战：ggplot2包及扩展包的使用实操看不见的线 2025-03-10 08:20:55 330 点赞 收藏
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课程链接【课程】R语言入门与高通量测序数据实战处理【课程】R语言实战：ggplot2包及扩展包的使用实操看不见的线 2025-03-07 08:26:36 291 点赞 收藏
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Easyfig无法正常运行的问题通常与BLAST的配置及路径设置有关。本文将从“BLAST是否能正常使用”，“Easyfig是否能正常调用BLAST”，以及“其他问题”三个方面，详细分析Easyfig无法正常运行的原因，并提供相应的解决方案。注意请优先排除序列本身的问题，每个gbk文件必须是单条序列，且文件均含有Features（注释部分）和Ori看不见的线 2025-03-06 10:00:47 345 点赞 收藏
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暂无简介看不见的线 2025-03-05 09:12:36 269 点赞 收藏
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问题：在基因簇比较分析时，研究人员通常需要为不同功能的基因赋予不同的颜色，以更直观地展示基因功能的多样性。然而，基因簇分析工具Easyfig软件默认仅支持为所有基因统一设置颜色，这在很大程度上限制了可视化效果。为此，本文将详细介绍两种实现基因特异性着色的解决方案。方法：•其一，将分析结果导出为矢量图后，借看不见的线 2025-03-04 10:13:27 303 点赞 收藏
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暂无简介看不见的线 2025-03-03 09:49:51 269 点赞 收藏
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问题：在基因组分析过程中，我们时常会遇到需要调整GenBank文件序列起始位置的情况。这种需求可能源于两个主要原因：一是原始文件设定的起始位置不够合理（如位于基因编码区内部）；二是基于比较基因组学研究的需求（如进行基因簇比对分析）。示例：如图1所示pCQ02-121是我们需要调整的序列，此时起始的第一个基因是putativ看不见的线 2025-02-28 11:50:51 372 点赞 收藏
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简述一项对于新型多粘菌素B(POLB)异质性耐药(PHR)的碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的临床相关性、机制和进化进行的基因组学回顾性队列研究。将来自154名接受POLB治疗的患者的544个CRKP分离株分为PHR组和非PHR组，统计分析比较其临床意义和治疗反应。利用全基因组测序、生物信息学和PCR研究了PHR背后的分子流行病学机制以及看不见的线 2025-02-27 11:34:55 403 点赞 收藏
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在进行iTOL注释时，第一列填写的往往是样本或分支的名称，因为所有注释的内容都需要对应到特定的样本或分支，所以样本和分支名称准确与否尤为重要。关于样本名称（两项基本原则）①样本名称必须与提交的树文件保持一致；最容易出现的是符号不一致的情况，特别是构建进化树时的序列文件名称与整理注释数据时的样本名称不匹配看不见的线 2025-02-26 08:44:15 383 点赞 收藏
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背景过去20年来，耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌（Carbapenem-resistantAcinetobacterbaumannii，CRAb）已成为感染的重要病原菌之一，尤其影响基础健康状况较差或患有严重基础疾病的患者，其感染后致死率较高。不同地区之间CRAb菌株克隆谱系的差异对患者的临床特征和预后的具体影响尚未完全明确。了解不同地区CRAb感染的临床结局看不见的线 2025-02-25 10:14:21 347 点赞 收藏
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在进化树美化项目中，无论是添加样本信息或基因组数据，还是更改分支形式或样本名称，都可以通过Datasets来完成，这里我们整理了进化树Datasets注释的3种不同方式。Method1：在Datasets面板中创建数据库并填写数据①在Datasets中选择“Createadataset”，根据需要注释的信息选择合适的展示方式“Type”，并创建数据集。②创看不见的线 2025-02-24 08:35:30 376 点赞 收藏
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摘要CRKP因其多重耐药性和高死亡率而成为公众健康的“严重”威胁。为了设计针对CRKP表面多糖抗原的免疫策略，迫切需要了解全国范围内CRKP耐药，毒力和血清流行病学，从而获得更精确的流行病学数据来促进针对CRKP感染的有效预防策略制定。本研究进行了为期五年（2016-2020）的多中心研究，通过多种分子生物学和生物信息学方看不见的线 2025-02-21 10:45:02 443 点赞 收藏
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在使用iTOL注释模板之前，我们先要了解模板的基本原理。如下图所示，在tol_binary这个模板中，所有条目前带有“#”的是用于解释模板内容的说明文本，不参与iTOL注释；而未携带“#”的则是实际参与注释的内容，它们与结果的呈现直接相关。在理解了这一点后，我们再来看iTOL注释模板的各部分内容。如下图所示，iTOL模板可以由看不见的线 2025-02-20 08:44:26 485 点赞 收藏
