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物种和分类学预测网站Pathogenwatch的使用方法介绍
Pathogenwatch(https://pathogen.watch/)是一个包含多种病原菌分型结果的综合分析预测平台。该网站的功能主要为MLST和菌种预测,某些物种可以进行cgMLST、AMR预测和血清型预测等。此外该网站统计了部分病原菌的分型结果,并在地图上以可视化的方式进行了
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2023-11-28 09:14:15
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PHASTEST介绍-PHAST和PHASTER的升级版
PHAST和PHASTER自发布以来,已经被越来越多研究者应用于前噬菌体的预测和分析,今年Wishart,D.S等人在原先的技术上做了改进并开发了一款新的PHASTEST软件作为PHAST、PHASTER的升级版,当然原先的平台仍然保留。这里先说一下结论,PHASTEST的升级主要包括两个
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2023-11-23 10:44:47
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MLST的原理和适用范围
多位点序列分型(MultilocusSequenceTyping,MLST)是由多位点酶电泳(multilocusenzymeelectrophoresis,MLEE)衍生出来的一种分型方法。一般每种细菌会确定6~10个管家基因作为分型参考的位点,并根据同一管家基因的等位基因序列差异按照发现的时间顺序赋予一
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2023-11-23 10:26:15
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常见的MLST在线分析网站
今天给大家分享的是一些常见的MLST在线分析网站,这些网站除了都包含基础的预测功能外,有些还具有多个物种的等位基因数据库,有助于我们更好地进行分子遗传学和流行病学的研究。综合MLST预测网站(能预测多种细菌的MLST分型)1、PubMLST(https://pubmlst.org
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2023-11-23 10:20:21
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