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    统计基因、基因组序列长度、GC含量和GC-skew

    Seqkit2是Seqkit的新版本，是一个专门用于处理和分析生物序列数据的软件工具。它支持多种序列数据格式，包括FASTA、FASTQ等，并提供了一系列有用的功能，如数据处理、过滤、统计、格式转换等，是生物信息学领域中常用的工具之一。以下是使用seqkit统计基因、
    看不见的线 2025-06-30 08:34:33 17 0 0
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    RNA/DNA序列相互转换

    Seqkit2是Seqkit的新版本，是一个专门用于处理和分析生物序列数据的软件工具。它支持多种序列数据格式，包括FASTA、FASTQ等，并提供了一系列有用的功能，如数据处理、过滤、统计、格式转换等，是生物信息学领域中常用的工具之一。以下是使用seqkit实现RNA/DNA
    看不见的线 2025-06-27 09:57:40 89 0 0
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    将FastA、FastQ文件拆分成多个文件

    Seqkit2是Seqkit的新版本，是一个专门用于处理和分析生物序列数据的软件工具。它支持多种序列数据格式，包括FASTA、FASTQ等，并提供了一系列有用的功能，如数据处理、过滤、统计、格式转换等，是生物信息学领域中常用的工具之一。以下是使用seqkit实现将FastA
    看不见的线 2025-06-25 13:41:07 118 0 0
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    Seqkit2软件的主要功能和安装方法

    Seqkit2是Seqkit的新版本，是一个专门用于处理和分析生物序列数据的软件工具。它支持多种序列数据格式，包括FASTA、FASTQ等，并提供了一系列有用的功能，如数据处理、过滤、统计、格式转换等，是生物信息学领域中常用的工具之一。Seqkit2安装方法Linux操作系
    看不见的线 2025-06-23 08:48:51 204 0 0
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    新型ST6417 CR-hvKP的发现

    新型ST6417碳青霉烯耐药高毒力肺炎克雷伯菌（CR-hvKP）分离株CR2021由哈尔滨医科大学团队首次报道。分子分型结果显示，ST6417菌株源于中国最流行的ST23型高毒力肺炎克雷伯菌（hvKP），其tonB基因相对ST23存在单一位点变异（C239A突变）。因此，ST6417CR-hvKP
    看不见的线 2025-06-20 10:09:58 386 0 0
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    NCBI蛋白质BLAST检索数据库最新变更

    1、NCBI蛋白数据库变更自2025年8月起，ClusteredNR将取代传统的标准NR数据库，成为蛋白质BLAST搜索的默认数据库。这一变更旨在提升搜索效率和结果质量。当然，传统的NR数据库仍可通过手动选择继续使用。2、ClusteredNR的优势更快的搜索速度：通过聚类减少数据
    看不见的线 2025-06-16 08:46:55 467 0 0
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    BLAST软件自定义输出表格样式

    BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool）是一款由NCBI（美国国家生物技术信息中心）提供的生物信息学工具，用于比较基因或蛋白质序列。以下是如何设置比对结果输出为outfmt6时指定输出特定数据。#指定输出指定内容#-outfmt"6qseqidsseqidpidentevaluebitscore
    看不见的线 2025-06-13 08:55:26 283 0 0
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    BLAST软件输出结果的整理与后加工

    BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool）是一款由NCBI（美国国家生物技术信息中心）提供的生物信息学工具，用于比较基因或蛋白质序列。以下是如何在表格中完成，添加表头、过滤identity值、保留唯一匹配等，以outfmt6默认输出结果为例。1.添加表头#创建一个包
    看不见的线 2025-06-11 08:51:13 315 0 0
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    Blast比对结果的输出方式和结果解读

    BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool）是一款由NCBI（美国国家生物技术信息中心）提供的生物信息学工具，用于比较基因或蛋白质序列。比对结果通过outfmt参数指定输出格式，官方提供的输出格式是19种，值分别是0-18，以下是具体的介绍。outfmt0软件默认的输
    看不见的线 2025-06-09 15:24:59 319 0 0
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    BLAST本地比对操作指南

    BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool）是一款由NCBI（美国国家生物技术信息中心）提供的生物信息学工具，用于比较基因或蛋白质序列。以下是如何在本地使用BLAST工具进行核酸或蛋白序列比对。一、常用BLAST子模块简介子模块名称查询序列类型数据库序列类型比
    看不见的线 2025-06-06 08:57:25 555 0 0
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    Linux操作系统blast安装

    BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool）是一款由NCBI（美国国家生物技术信息中心）提供的生物信息学工具，用于比较基因或蛋白质序列。以下是如何在Linux系统中安装和使用BLAST的完整步骤。①下载BLAST安装包wgethttps://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executab
    看不见的线 2025-06-04 15:48:38 411 0 0
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    Windows操作系统BLAST安装

    BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool）是一款由NCBI（美国国家生物技术信息中心）提供的生物信息学工具，用于比较基因或蛋白质序列。以下是如何在Windows系统中安装和使用BLAST的完整步骤。①下载BLAST安装包访问NCBI的BLAST页面（https://ftp.ncbi.nlm.nih
    看不见的线 2025-05-30 09:28:12 424 0 0
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    Xftp:本地和服务器间数据传输

    Xftp是由NetSarang开发的一款轻量级的SFTP/FTP文件传输工具。它可以帮助用户在本地计算机和远程服务器之间通过安全的加密协议（如SFTP、FTP等）进行文件上传、下载和管理。可访问官网（https://www.xshell.com/zh/free-for-home-school/）下载xftp安装包，此
    看不见的线 2025-05-26 17:41:46 448 0 0
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    SCP:本地和服务器间数据传输

    SCP（SecureCopyProtocol）是一个基于SSH（SecureShell）的协议，用于在本地计算机和服务器之间安全地传输文件。SCP命令在数据传输过程中会加密数据，确保数据的安全性和完整性。在Linux系统中，SCP是一个常用的命令行工具，用于上传文件到服务器或从服务器下
    看不见的线 2025-05-26 17:40:11 362 0 0
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    知识小卡片 | 气泡图怎么看

    什么是气泡图？气泡图（BubbleChart）是一种通过气泡的大小、颜色和位置来展示数据关系的图表形式。它通常用于显示三维或多维数据，除了传统的X轴和Y轴坐标外，气泡的大小和颜色可以代表数据的其他变量或特征。气泡图能够帮助分析者在有限的空间内同时展示多
    看不见的线 2025-05-26 17:02:46 570 0 0
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    知识小卡片 | 热图怎么看

    课程链接【课程】R语言入门与高通量测序数据实战处理【课程】R语言实战：ggplot2包及扩展包的使用实操
    看不见的线 2025-05-14 08:25:30 572 0 0
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    知识小卡片 | 鲍曼不动杆菌IC的现状和全球分布

    课程链接【课程】微生物分子分型-MLST【课程】cgMLST分析实战营：微生物分型技术进阶课
    看不见的线 2025-05-08 09:40:20 576 0 0
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    知识小卡片 | 鲍曼不动杆菌的国际流行克隆IC概述

    课程链接【课程】微生物分子分型-MLST【课程】cgMLST分析实战营：微生物分型技术进阶课
    看不见的线 2025-05-06 09:04:59 538 0 0
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    细菌质粒复制子预测与结果解析

    可用分析工具：PlasmidFinder（https://cge.food.dtu.dk/services/PlasmidFinder/）：依据质粒不相容性Reptyping（Inc）预测肠杆菌及部分革兰氏阳性菌的复制子（replicon）。pMLST（https://cge.food.dtu.dk/services/pMLST/）：预测IncF的亚型IncFIA、IncFIB
    看不见的线 2025-04-30 10:17:36 736 0 0
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    知识小卡片 | 常用β多样性分析方法的应用场景和特点

    课程链接【课程】微生物菌群研究必修课：从深入理解到灵活应用【课程】细菌与真菌扩增子测序：零基础到高级分析的全流程实战
    看不见的线 2025-04-28 10:45:31 600 0 0
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    知识小卡片 | 如何理解菌群α多样性

    课程链接【课程】微生物菌群研究必修课：从深入理解到灵活应用【课程】R语言入门与高通量测序数据实战处理
    看不见的线 2025-04-24 08:52:22 596 0 0
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    iTOL进化树外周条带个性化调整方法

    引言进化树外周条带注释的样式调整（如边线与色块）可显著提升数据可视化效果。本文通过解析文献案例（示例一至示例四），系统阐述不同注释样式的实现方法，并揭晓其设计逻辑。文中所有示例均可基于iTOL工具，通过调整模板参数或网页界面操作完成。如何添加外
    看不见的线 2025-04-23 14:43:21 606 0 0
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    微生物分型进化核心术语解析

    核心术语•Phylogroup：系统发育群•L（Lineage）：谱系•SL（Sublineage）：亚谱系•Cluster：簇•Internationalclone（IC）：国际流行克隆•CC（clonalcomplex）：克隆复合体•CG（clonalgroup）：克隆群•CT（clonaltype）：克隆型•MLST（multilocusseque
    看不见的线 2025-04-22 09:48:11 650 0 0
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    知识小卡片 | 三代测序数据组装工具

    课程链接【课程】微生物基因组研究生信入门必修课【课程】微生物测序数据和基因组数据上传NCBI实操
    看不见的线 2025-04-18 10:00:43 695 0 0
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【勤学如春起之苗，不见其增日有所长。假以时日，你定会为你的努力学习而倍感骄傲，加油！】