Kaptive脂多糖血清型分类系统更新

2025年4月30日，Kaptive发布了最新的Kaptive v.3.1+，对肺炎克雷伯菌脂多糖（LPS）血清型（O locus和O type）的分类系统进行了全面升级。与之前的Kaptive v.2.0.8～Kaptive v.3.0.0b6版本相比，Kaptive v.3.1+通过引入基于生化结构的标准化命名体系细化了肺炎克雷伯菌的O type分类，显著提升了O type的精确性与可扩展性。

1、血清型分类的分子基础

K locus：依赖荚膜多糖合成基因簇（CPS biosynthesis gene cluster）划分血清型；

O locus：依赖脂多糖合成基因簇（LPS biosynthesis gene cluster）和extra genes划分血清型。

两者的差异在于O locus需要extra genes协助划分血清型，这些基因用于延长重复单元或添加侧链或添加其他修饰（乙酰化、丙酮酸化）。

2、新命名法的结构依据

O2⍺：所有O2和O1多糖共享相同骨架结构：N-乙酰葡糖胺（GlcNac）连接半乳呋喃糖（Galf）与半乳吡喃糖（Galp）重复单元。

O2β：在O2⍺骨架的重复单元上添加半乳吡喃糖侧链。

O2𝛾：O2⍺骨架的重复单元中半乳呋喃糖被乙酰化（由于乙酰化仅约40%，故细胞表面实际呈现O2⍺与O2𝛾混合多糖），扩展命名记为O2⍺𝛾。

上述O2多糖均可被额外重复单元加帽修饰，转化为不同血清组：

O1⍺：由半乳吡喃糖二糖重复单元构成。

O1β：通过丙酮酸化修饰O1⍺获得（由于仅约50%链被修饰，实际产生O1⍺与O1β混合物），扩展命名记为O1⍺β。

O11：

旧称O2ac的多糖在新命名中被划分为新血清组O11，与O1血清组类似。O11由O2多糖（O2⍺/O2β/O2⍺𝛾）加半乳吡喃糖与N-乙酰葡糖胺构成。根据是否丙酮酸化分为O11⍺和O11β，实际菌株因产生混合物而记为O11⍺β。

3、新旧命名法数据库对比

参考资料

Kaptive官网（https://kaptive.readthedocs.io/en/latest/index.html）

Kaptive文献（O-antigen polysaccharides in Klebsiella pneumoniae: structures and molecular basis for antigenic diversity.Microbiol Mol Biol Rev. 2025;89(2):e0009023. doi:10.1128/mmbr.00090-23）