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第一部分：大肠埃希菌的流行病学分型1.1系统发育分型（Phylogroup）大肠埃希菌（Escherichiacoli）通常使用phylogroup（称为亚特异性群体/亚种分型）来反映其种内的集群特征，它是根据多位点酶电泳检测到的酶编码基因的等位基因变异确定的。如图1所示，目前，

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第一部分：病毒分类与命名的通用规则1、病毒分类的负责机构病毒的分类和命名一般由国际病毒分类委员会（ICTV）负责，但ICTV不负责种以下的分类如血清型、基因型等，这些需要由国际专家小组确定。2、病毒分类层级与最新统计ICTV于2019年5月发布的病毒分类表将

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一、关于BLAST比对BLAST全称为BasicLocalAlignmentSearchTool，即基于局部序列比对算法的搜索工具，是由美国国家生物技术信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation,NCBI）开发和管理的一套生物大分子一级结构序列比对程序。程序可将输入的核酸碱

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文章题目：GenomicepidemiologyandphylodynamicsofAcinetobacterbaumanniibloodstreamisolatesinChina文章链接：https://doi.org/10.1038/s41467-025-58772-9发表时间：2025.4发表期刊：NaturecommunicationsIF：15.7研究背景鲍曼不动杆菌是一种机会性病原体

一、什么是多序列比对？多序列比对（MultipleSequenceAlignment,MSA）是一种将多个生物学序列（如DNA、RNA或蛋白质序列）进行比对排列，以识别它们之间相似性和差异性的生物信息学方法。在比对过程中，多个序列中相同或相似的部分会尽可能被对齐到同一列，而

文章题目：BacterialsocialinteractionsinsyntheticBacillusconsortiaenhanceplantgrowth文章链接：https://doi.org/10.1002/imt2.70053发表时间：2025-06-08期刊：iMeta影响因子：23.8研究背景植物根际促生细菌（PGPR）代表了一种可持续提高作物生产力的手段

今天我们来聊聊Linux世界里一个看似简单，却无处不在、超级实用的命令——cat。什么是cat？“cat”其实是concatenate连接）的缩写。不过别担心，它的功能远不止“连接”这么简单，堪称命令行里的“文件查看&操作小能手”。cat的核心功能大盘点：​1.查看文件

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随着基因组学与组学研究的快速发展，研究人员面临着海量数据的处理和存储挑战。高通量测序技术（如二代测序、三代测序等）所产生的数据量巨大，常常达到数百GB甚至TB级别，如何高效、快速地存储和传输这些数据成为了一个关键问题。Pigz（ParallelImplementati

在日常的编程和系统管理工作中，我们常常需要处理大量的文本数据，如何高效地从中筛选出有用的信息呢？今天，我要介绍一个非常强大、又简单易用的命令行工具——Grep。什么是Grep？Grep（GlobalRegularExpressionPrint）是一个基于正则表达式的文本搜索工具，

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