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Nature reviews microbiology | 肺炎克雷伯菌的群体基因组学研究
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背景知识:肺炎克雷伯菌(Klebsiellapneumoniae)属于肠杆菌科,其中包括沙门氏菌属(Salmonella)和埃希氏菌属(Escherichia)。肺炎克雷伯菌是世界上最常见的医院病原体之一,也是新生儿败血症的主要原因。世界卫生组织认识到产生广谱β-内酰胺(ESBL)和耐碳
唯那生物
2023-01-06 15:17:15
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细菌基因组研究
文献速览 | 铜绿假单胞菌铁获取新机制T6SS效应蛋白研究
文章题目:APseudomonasT6SSeffectorrecruitsPQS-containingoutermembranevesiclesforironacquisition文章链接:https://doi.org/10.1038/ncomms14888发表时间:2017.03期刊:Naturecommunications影响因子:14.7研究概述这篇论文研究了铜绿假单胞菌(Pseudom
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2025-03-28 08:23:18
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微生物研究
综述 | 理解细菌生态学以对抗抗生素耐药传播
文章题目:Understandingbacterialecologytocombatantibioticresistancedissemination文章链接:doi:10.1016/j.tibtech.2024.12.011发表时间:2025.01期刊:Trendsinbiotechnology影响因子:14.3引言环境来源的抗生素耐药性传播日益受到关注。尽管抗生素耐药
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2025-03-25 09:05:41
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细菌基因组研究
文献解读 | 临床难治性铜绿假单胞菌携带blaAFM高拷贝IncP-2巨质粒,导致头孢地尔高水平耐药!
文章标题:High-copyIncP-2megaplasmidcarryingblaAFMinclinicaldifficult-to-treatresistancePseudomonasaeruginosa:Associatedwithhigh-levelcefiderocolresistance发表时间:2025.2发表期刊:TheJournalofinfectionDOI:10.1016/j.cmi.2024.01.014IF:14.3
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2025-03-11 08:22:17
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细菌基因组研究
文献速览 | CRKP多粘菌素B异质性耐药的临床相关性、机制和进化
简述一项对于新型多粘菌素B(POLB)异质性耐药(PHR)的碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的临床相关性、机制和进化进行的基因组学回顾性队列研究。将来自154名接受POLB治疗的患者的544个CRKP分离株分为PHR组和非PHR组,统计分析比较其临床意义和治疗反应。利用全基
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2025-02-27 11:34:55
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细菌基因组研究
【文献速递】全球不同地区碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌患者的临床结局及细菌特征
背景过去20年来,耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(Carbapenem-resistantAcinetobacterbaumannii,CRAb)已成为感染的重要病原菌之一,尤其影响基础健康状况较差或患有严重基础疾病的患者,其感染后致死率较高。不同地区之间CRAb菌株克隆谱系的差异对患者的临床特征
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2025-02-25 10:14:21
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细菌基因组研究
【文献速递】中国耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌荚膜血清型、抗生素耐药性和毒力因子分布的纵向多中心研究
摘要CRKP因其多重耐药性和高死亡率而成为公众健康的“严重”威胁。为了设计针对CRKP表面多糖抗原的免疫策略,迫切需要了解全国范围内CRKP耐药,毒力和血清流行病学,从而获得更精确的流行病学数据来促进针对CRKP感染的有效预防策略制定。本研究进行了为期五年
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2025-02-21 10:45:02
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细菌基因组研究
文献解读 | 2010-2022年中国铜绿假单胞菌头孢他啶-阿维巴坦高水平耐药机制研究
文献解读|2010-2022年中国铜绿假单胞菌头孢他啶-阿维巴坦高水平耐药机制研究文章题目:Genomicepidemiologyandceftazidime-avibactamhigh-levelresistancemechanismsofPseudomonasaeruginosainChinafrom2010to2022文章链接:doi:10.1080/22221751.2024.232406
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2025-02-19 16:51:47
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细菌基因组研究
文献速览 | 国内ST463型KPC-PA的快速扩张及其相关质粒的进化历程
文章题目:DecadalEvolutionofKPC-relatedplasmidsinPseudomonasaeruginosahigh-riskcloneST463inZhejiang,China文章链接:doi:10.1038/s42003-024-07337-5发表时间:2024.12期刊:Communicationsbiology影响因子:5.2概述本研究探讨了我国浙江省高风险克隆株
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2025-02-19 11:23:15
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细菌基因组研究
系统发育树的构建与优化:从序列选择到进化树美化
一、系统发育树的基本情况系统发生树(Phylogenetictree),一般也叫系统进化树或简称进化树,可基于分子进化的假设,基于特定的算法,构建展示一定的树状分支图形来表示物种或基因之间的进化关系。所使用的数据一般是核苷酸或者氨基酸序列,所使用的算法常用
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2025-02-15 16:08:29
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微生物多组学研究
低聚半乳糖与罗伊氏乳酸杆菌协同富集产酸拟杆菌合成十五烷酸缓解肠道炎症与屏障损伤
文章简介英文题目:GalactooligosaccharidesandLimosilactobacillusreuterisynergisticallyalleviategutinflammationandbarrierdysfunctionbyenrichingBacteroidesacidifaciensforpentadecanoicacidbiosynthesis中文题目:低聚半乳糖与罗伊氏乳酸杆菌协同富集
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2025-02-12 08:22:51
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细菌基因组研究
跟着Nature学细菌耐药基因分析:实时基因组学检测隐藏的抗生素耐药性
克雷伯菌耐药性严重,尤其是耐碳青霉烯类菌株广泛传播,导致常规治疗失效和患者死亡风险增加。研究其耐药机制和开发新型药物迫在眉睫,以应对这一公共卫生威胁。今天我们就一起来学习下面这篇关于克雷伯菌耐药性文章的研究思路和生信分析方法。这篇文章的生信
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2025-02-11 11:50:58
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微生物研究
Nature最新综述 | 真菌对地球生态系统的影响:机遇与挑战并存
在过去的十亿年中,真菌界已经多样化到超过200万个物种,其中超过95%的物种尚未被描述。真菌不仅是众所周知的蘑菇和酵母,它们还是异养生物,几乎可以以任何有机碳为食,通过分解死亡的植物和动物来回收养分,并将碳封存到地球的生态系统中。人类对真菌的应用
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2025-02-10 08:21:48
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细菌基因组研究
mBio:1 型菌毛介导的针对于VI型分泌系统的集体抵抗
摘要:细菌的竞争可能依赖于分泌系统,如VI型分泌系统(typeVIsecretionsystem,T6SS),它能刺穿并向邻近细胞释放有毒分子。为了生存,细菌目标必须抵御携带T6SS竞争者带来的威胁。在这项研究中,我们采用了一种全面的全基因组高通量筛选方法来研究细菌间竞争
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2024-09-24 14:27:59
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细菌基因组研究
ISME:假单胞菌 T6SS 是抵御植物病原体的守护神
原文献信息:BernalP,AllsoppLP,FillouxA,andLlamasMA.ThePseudomonasputidaT6SSisaplantwardenagainstphytopathogens.TheISMEJournal.2017;11,972-987.摘要:细菌VI型分泌系统(T6SS)是设计用来将毒性效应物传递到猎物细胞中的分子武器。这些纳米机器在细菌
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2024-09-24 14:20:49
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微生物宏基因组研究
宏基因组揭示水产养殖环境耐药基因的移动和共存
中文题目:宏基因组揭示非集约化水产养殖环境和人类之间耐药基因的移动性和共存性期刊及年份:Microbiome,2024年6月https://doi.org/10.1186/s40168-024-01824-x通讯作者:毛艳萍,深圳大学化学与环境工程学院,研究兴趣在于了解更多关于废水处理过程的机制
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2024-09-24 14:05:29
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微生物研究
【文献速递】中国ESKAPE耐药菌的流行病学特征分析
01研究背景抗菌药物耐药(antimicrobialresistance,AMR)已成为21世纪主要的公共卫生威胁,造成了严重的社会和经济负担。中国抗菌药物的不合理使用是一个重要的问题,导致了严重的细菌耐药。近年来,中国发布了两份《遏制微生物耐药国家行动计划(2016-2020,20
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2024-08-05 17:03:04
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细菌基因组研究
文献解读 | ST15 blaOXA-232肺炎克雷伯菌的全球系统地理学和基因组流行病学研究
文章题目:GlobalPhylogeographyandGenomicEpidemiologyofCarbapenem-ResistantblaOXA-232-CarryingKlebsiellapneumoniaeSequenceType15Lineage文章链接:doi:10.3201/eid2911.230463发表时间:2023.11发表期刊:EmergInfectDisIF:7.2研究背景:中国携带blaO
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2024-07-22 09:36:28
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细菌基因组研究
文献解读-2013-2022年希腊医院产碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌高风险克隆的出现和持续传播
文章题目:Emergenceandpersistentspreadofcarbapenemase-producingKlebsiellapneumoniaehigh-riskclonesinGreekhospitals,2013to2022文章链接:doi:10.2807/1560-7917.ES.2023.28.47.2300571发表时间:2023.11发表期刊:EuroSurveillIF:9.9研究背景:肺炎克
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2024-07-22 09:33:04
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