【课程】微生物抗性与毒力基因注释：ABRicate软件全能实战

课程简介

本课程专为病原微生物微生物学研究人员而开发，课程深入讲解了ABRicate软件的安装与使用，演示和解读了预测微生物的抗性基因和毒力基因的具体方法。ABRicate是一款功能强大的工具，集成了多个权威数据库，包括：

• （1）NCBI AMRFinderPlus NCBI耐药数据库
• （2）CARD 综合性的耐药数据库
• （3）Resfinder耐药数据库
• （4）ARG-ANNOT 非冗余耐药数据库
• （5）MEGARES 人工校正的抗性基因数据库，包括抗生素抗性基因，杀虫剂抗性基因以及重金属抗性基因
• （6）EcOH 大肠杆菌O/H抗原数据库
• （7）PlasmidFinder 质粒数据库
• （8）VFDB 毒力基因数据库
• （9）Ecoli_VF 大肠杆菌毒力因子预测

通过本课程，您将学会如何使用ABRicate对上述任意数据库进行基因注释分析，从而深入解读相关的生物信息学数据。

课程内容

（1）ABRicate软件简介：了解ABRicate的基本功能与应用场景。

（2）ABRicate软件安装指南：详细演示如何在不同操作系统上安装ABRicate。

（3）线下数据库更新：学习如何更新并维护ABRicate所需的本地数据库。

（4）分析运行与操作：实操演示如何选择数据库并进行基因注释分析。

（5）结果解读与报告生成：掌握如何解读分析结果，并生成有价值的研究报告。