课程简介
本套课程立足于帮助微生物菌群多样性和宏基因组测序研究的科研人员深入理解微生物组学研究的方案设计、分析原理，课程还提供了关键结果的解读、异常结果的处理方案等，以此来指导科研人员灵活使用结果文件或对结果文件做合理的后续加工处理。
本套课程作为微生物菌群多样性和宏基因组测序研究的入门课，可以引导科研人员快速梳理结果数据，实用性强，具有很高的含金量。
课程内容
（1）选对方法选对路：如何选择合适的测序方法？ 典型文章的设计思路是怎样的？可以怎么整合各类数据使文章更具有科研价值？
（2）深入浅出读懂α、β多样性：理解背后原理，学会灵活使用，避免误区。
（3）异常样本的识别与处理：如何判断和找出异常样本？如何合理处理异常样本？
（4）多组学关联分析与网络分析：提炼与升华，让文章和结果数据展示出更大的价值。
课程目录大纲详情
课时1：微生物菌群研究的测序方法该如何选择？
（1）微生物菌群研究能做什么？
（2）微生物菌群研究方法？
（3）扩增子测序扩增区域选择
（4）菌群研究文章案例分享
课时2：微生物菌群多样性和宏基因组研究入门必知要点
（1）生物学重复生物学重复设置的作用和推荐数量
（2）物种注释结果解读（Unassigned、norank、unclassified如何理解）
（3）16S功能预测与宏基因组的区别
（4）α多样性的作用和指数选择
（5）β多样性的作用和方法选择
（6）分析结果不符合预期的原因和补救
课时3：微生物菌群研究的文章设计和数据整合
（1）微生物菌群研究文章设计思路
（2）微生物菌群研究样本采集
（3）微生物菌群研究数据整合和结果呈现
课时:4：α多样性指数的意义、区别和选用指南（含案例数据和分析脚本）
（1）常见α多样性指数详解
（2）α多样性指数如何使用
（3）α多样性指数计算和可视化
课时5：带你读懂β多样性
（1）β多样性的概念
（2）距离算法选择
（3）β多样性结果可视化
课时6：如何判断异常样本，如何处理
（1）哪些环节可以判断异常样本
（2）如何处理异常样本
（3）如何避免异常样本的影响
课时7：跟着文章学分析：多组学关联分析（医学篇）
（1）菌群研究常用组学研究方法
（2）多组学研究的优势和应用
（3）案例分析 扩增子+非靶向代谢组
（4）案例分析 宏基因组+宏转录组
课时8：跟着文章学分析：相关性网络分析（农学篇）
（1）相关性网络概述
（2）相关性网络绘制方法
（3）案例分析 微生物类群的跨界相关性网络
（4）案例分析 微生物类群和耐药基因相关性网络
（5）案例分析 模块化相关性网络
