背景知识：肺炎克雷伯菌(Klebsiellapneumoniae)属于肠杆菌科，其中包括沙门氏菌属（Salmonella）和埃希氏菌属（Escherichia）。肺炎克雷伯菌是世界上最常见的医院病原体之一，也是新生儿败血症的主要原因。世界卫生组织认识到产生广谱β-内酰胺（ESBL）和耐碳

期刊介绍背景与意义一、研究背景关于碳青霉烯耐药基因blaNDM的全球传播。碳青霉烯是一类广谱抗生素，由于blaNDM基因的存在，导致细菌对碳青霉烯类抗生素产生耐药性。二、目的本研究旨在通过对blaNDM基因周围的结构变异进行分析，重建其进化历史，并揭示其传播

文章题目：MicroevolutionofPseudomonasaeruginosaintheairwaysofpeoplewithcysticfibrosis文章链接：doi:10.1016/j.coi.2023.102328发表时间：2023.8发表期刊：CurrOpinImmunolIF：7.0研究背景：人类宿主的长期细菌感染目前仅限于少数几种，即结核分枝杆菌、

在数据分析和可视化中，热图是一种用于展示数据集中的相对密度或频率的图形。它通过颜色来代表数字，让数据呈现更直观，对比更明显。示例数据（data1.csv）数据为丰度/表达量矩阵，表格需要带表头和列名，每一列为样本名，每一行为各种指标数据名，如OTU，基

在数据分析和可视化中，经常需要对某几组样本中共有或特有的基因，OTU或微生物进行可视化，通常可以选择维恩图进行可视化。但当分组信息过多，维恩图的展示能力及可读性则有所下降，因此推荐使用维恩图的升级版本—集合图(Upsetplot)。集合图主要由三部分组成

黏菌素和替加环素被誉为治疗临床多重耐药细菌感染的最后抗生素。然而目前在肺炎克雷伯菌中黏菌素和替加环素共耐药的菌株已多次发现，更重要的是它们引起黏菌素和替加环素耐药的方式并不完全相同，这就意味着肺炎克雷伯菌黏菌素和替加环素共耐药的产生机制具有

在数据分析和可视化中，韦恩图也叫温氏图、维恩图、范氏图，是一种用于展示集合之间的交集和并集关系的图形。韦恩图通常由一组圆形或椭圆形区域组成，每个区域代表一个集合，而集合之间的重叠部分则表示它们的交集。下面让我们一起学习如何使用R语言绘制韦恩

文章题目：Convergenceofplasmid-mediatedColistinandTigecyclineresistanceinKlebsiellapneumoniae文章链接：doi:10.3389/fmicb.2023.1221428发表时间：2024.1发表期刊：FrontMicrobiolIF：5.2研究背景：肺炎克雷伯菌（Klebsiellapneumoniae）对黏菌素的耐药

文章题目：Effectsofmicrobialagentandmicrobialfertilizerinputonsoilmicrobialcommunitystructureanddiversityinapeanutcontinuouscroppingsystem文章链接：doi:10.1016/j.jare.2023.11.028发表时间：2023.11发表期刊：JAdvResIF：10.7研究背景：花生连作的

在数据分析和可视化中，饼图和环形图是两种常用的图表类型，它们能够直观地展示数据的组成部分及其占比情况。首先，让我们来了解一下如何绘制饼图。准备数据（data1.csv）#加载所需的包library(dplyr)#数据预处理library(ggplot2)#绘图library(ggpubr)#绘图#

文章题目：Chasingthelandscapeforintrahospitaltransmissionandevolutionofhypervirulentcarbapenem-resistantKlebsiellapneumoniae文章链接：doi:10.1016/j.scib.2023.10.038发表时间：2023.12发表期刊：SciBull(Beijing)IF：18.9研究背景/目的：碳青霉耐药

在数据分析和可视化中，箱线图是一种常用且强大的工具，用于呈现数据的分布情况、离散程度和异常值。它能够直观地展示数据的中位数、四分位数、最大值、最小值以及异常值的存在，为我们提供了全面而直观的数据描述。箱线图的绘制原理箱线图主要由五个要素组成

文章题目：GlobalgenomicprofilingofKlebsiellapneumoniae:Aspatio-temporalpopulationstructureanalysis文章链接：doi:10.1016/j.ijantimicag.2023.107055发表时间：2024.2发表期刊：IntJAntimicrobAgentsIF：10.8研究背景/目的：肺炎克雷伯菌（Klebsiellapn

大家好，今天我们来介绍一种常用于生物信息学和基因表达分析的可视化工具——火山图。火山图通过展示基因的差异倍数和统计显著性的关系，帮助我们快速了解基因表达中的重要变化。下面让我们一起学习如何使用R语言绘制火山图吧！示例数据（data1.csv）数据中包

文章题目：BiogeographyanddiversitypatternsofabundantandrarebacterialcommunitiesinricepaddysoilsacrossChina文章链接：doi:10.1016/j.scitotenv.2020.139116发表时间：2020.8发表期刊：SciTotalEnvironIF：9.8研究背景/目的：细菌多样性和生物地理模式的

在数据可视化中，散点图是一种常用且强大的工具，可以帮助我们直观地展示两个变量之间的关系。而R语言中的ggplot2包提供了灵活而强大的功能，使得绘制精美的散点图变得简单而富有表现力。下面将介绍如何使用ggplot2包来绘制令人印象深刻的散点图：步骤1：安装

在数据可视化领域，ggplot2包凭借其强大的功能和灵活性成为了广大数据科学家和分析师们的首选工具之一。然而，除了强大的绘图能力之外，ggplot2还提供了丰富多样的内置主题，使得我们可以轻松地为我们的图形添加专业、精美的外观。ggplot2包中内置主题简介ggp

R语言是科研绘图中常用的工具，决定一个图表是否美观，除了数据本身外很大程度上还取决于配色是否合适，今天我们为大家介绍R语言中强大的调色工具——RColorBrewer调色板。什么是RColorBrewer？RColorBrewer是R语言中的一个优秀的调色工具包，它提供了一系列