知识小卡片 | 气泡图怎么看

什么是气泡图？
气泡图（Bubble Chart）是一种通过气泡的大小、颜色和位置来展示数据关系的图表形式。它通常用于显示三维或多维数据，除了传统的X轴和Y轴坐标外，气泡的大小和颜色可以代表数据的其他变量或特征。气泡图能够帮助分析者在有限的空间内同时展示多个变量之间的关系，并通过气泡的变化来呈现出复杂的数据结构。

气泡图的应用场景有哪些？
1. 基因表达分析：展示基因在不同条件下的表达水平，可以直观地识别哪些基因在特定条件下表达变化显著，从而找出关键的调控因子或潜在的生物标志物。
2. 群体间的基因差异比较：展示基因变异在不同群体中的分布，有助于揭示群体之间的遗传差异和进化规律。
3. 微生物群落分析：识别在不同条件下微生物群落的变化，并评估特定处理对微生物多样性的影响。
4. 蛋白质相互作用分析：展示蛋白质相互作用网络，尤其是在系统生物学中，以便快速识别关键的相互作用节点，并为后续的实验提供方向。

气泡图包括哪些组分？

①　标题：8周的年龄特异性蛋白质的富集分析
②　纵坐标：代表细胞的生物学功能（如生物过程、分子功能等）或者各分子发挥功能的通路（如代谢途径、致癌途径等）；
③　横坐标：表示通路的富集程度；数值越大说明在研究数据中该通路越显著
④　气泡面积大小：表示在该通路中显著富集的基因/蛋白质数量；气泡越大表示数量越多
⑤　气泡颜色：富集显著性，即P value或Q value数值的大小。颜色越接近橙色，P值越小；颜色越接近蓝色，P值越大

案例解读：该KEGG气泡图展示了8周的年龄特异性（age-unique）蛋白质主要参与脂质代谢过程、先天性免疫反应、磷酸化、免疫系统过程、离子转运、跨膜转运和免疫反应。