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Easyfig罕见问题1

  • 唯那生物
  • 814
  • 2023-07-28 14:10:54
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最近在使用Easyfig给客户绘制比较基因簇图时,出现了一种之前没有遇到过的问题。不添加基因标签,能够生成图像,而添加了基因标签以后无法生成正常的svg矢量图,但不影响bmp位图结果的生成。

此时打开svg文件,显示为下图的错误:

如果我们用AI打开,则结果为:

这种情况来源于gbk文件的基因标签中存在某些特殊字符。

我们用Notepad+打开svg的文件代码,可以看到正常情况如93行所示,基因标签为“nad1”,而83行由于“&”符号的存在,使得结果错误呈现为“cox1&2<tspan>”。

要解决这种情况有2种方式,一是在原始的gbk文件中进行修改;二是在svg的编码文件中修改,比如将cox1&2更改为cox1/2。

下图为我们修改后的结果:

Easyfig的其它问题可以详见我们新推出的课程《基于Easyfig软件实现基因簇结构比较及杂合质粒形成分子证据研究》。本套课程不是简单的软件操作指南,而是以常见科学问题为指引,教会大家如何通过easyfig软件实现比较基因组研究中常见热点问题的高效解决:

A. 目标基因簇结构的进化变异;

B. 目的基因遗传环境的多样性分析;

C. 基因水平转移分子证据研究;

D. 杂合质粒形成的分子证据研究;

E. 其他与基因结构变异相关的科学问题的解决。

本套课程中不仅包含对软件所有功能的介绍、操作演示,输入文件的准备、调整、修改,图片的高级加工等,同时对该软件能解决的科学问题进行系统的说明,从理论背景、问题提出、问题解决、结果呈现等环节教给大家问题的解决方案。

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