细菌基因组扫描图云平台支持从组装结果开始，共计13个模块多达30余项的分析统计内容。平台支持客户自主上传数据进行分析，用户可在云平台结果展示页面查看各个模块分析结果，并对结果进行筛选、比对等分析，也可以对相应结果进行下载。平台支持三种种类型的数

背景知识：肺炎克雷伯菌(Klebsiellapneumoniae)属于肠杆菌科，其中包括沙门氏菌属（Salmonella）和埃希氏菌属（Escherichia）。肺炎克雷伯菌是世界上最常见的医院病原体之一，也是新生儿败血症的主要原因。世界卫生组织认识到产生广谱β-内酰胺（ESBL）和耐碳

1.BWA软件的适用范围和应用场景bwa是一款将序列比对到参考基因组上的软件，包含了以下3种算法：BWA-backtrack:用于进行Illuminareads的比对，reads的长度最大为100bp。BWA-SW:用于比对long-read，支持的长度为70bp-1Mb；同时支持剪接性比对（splitalignments

文章题目：Transmissionofthehumanrespiratorymicrobiomeandantibioticresistancegenesinhealthypopulations文章链接：https://doi.org/10.1186/s40168-025-02107-9发表时间：2025-05-06期刊：Microbiome影响因子：13.8研究背景人类微生物组可在个体间传播，

PSI-BLAST即Position-SpecificIterated(PSI)-BLAST，是一种更加高灵敏的Blastp程序，对于发现远亲物种的相似蛋白或某个蛋白家族的新成员非常有效，适用于使用标准的Blastp比对失败时，或比对的结果仅仅是一些假基因或推测的基因序列时（"hypotheticalprotein"

文章题目：LactatepromotesinvasiveKlebsiellapneumoniaeliverabscesssyndromebyincreasingcapsularpolysaccharidebiosynthesisviathePTS-CRPaxis文章链接：https://doi.org/10.1038/s41467-025-61379-9发表时间：2025.7发表期刊：NaturecommunicationsIF：15

RPS-BLAST类似于HMMER，可用于在CDD数据库里搜索某蛋白是否含有一domain或者是否属于某一family寻找蛋白序列具有的保守Domain。蛋白序列的Domain对于蛋白质来说是最重要的一部分，一般来说会有发挥功能的区域，结合其它物质的区域，二聚化区域等等。RPS-Blast

文章题目：Globalbiogeographyandecologicalimplicationsofcobamide-producingprokaryotes文章链接：https://doi.org/10.1093/ismejo/wrae009发表时间：2024-01期刊：TheISMEJournal影响因子：10.8研究背景钴胺素（如维生素B12）是一类仅由特定原核生物合成的

Kleborate是一款用于分析肺炎克雷伯菌（Klebsiellapneumoniae）基因组数据的生物信息学工具，主要用于检测其毒力因子、耐药基因、ST型和血清型。该工具由澳大利亚学者开发，旨在快速评估肺炎克雷伯菌的临床和流行病学特征，尤其关注高毒力（hvKP）和高耐药（