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知识小卡片 | 如何理解菌群α多样性

课程链接【课程】微生物菌群研究必修课：从深入理解到灵活应用【课程】R语言入门与高通量测序数据实战处理

看不见的线 2025-04-24 08:52:22 12 0 0
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iTOL进化树外周条带个性化调整方法

引言进化树外周条带注释的样式调整（如边线与色块）可显著提升数据可视化效果。本文通过解析文献案例（示例一至示例四），系统阐述不同注释样式的实现方法，并揭晓其设计逻辑。文中所有示例均可基于iTOL工具，通过调整模板参数或网页界面操作完成。如何添加外

看不见的线 2025-04-23 14:43:21 30 0 0
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微生物分型进化核心术语解析

核心术语•Phylogroup：系统发育群•L（Lineage）：谱系•SL（Sublineage）：亚谱系•Cluster：簇•Internationalclone（IC）：国际流行克隆•CC（clonalcomplex）：克隆复合体•CG（clonalgroup）：克隆群•CT（clonaltype）：克隆型•MLST（multilocusseque

看不见的线 2025-04-22 09:48:11 43 0 0
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知识小卡片 | 三代测序数据组装工具

课程链接【课程】微生物基因组研究生信入门必修课【课程】微生物测序数据和基因组数据上传NCBI实操

看不见的线 2025-04-18 10:00:43 94 0 0
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知识小卡片 | 三代测序常用技术

课程链接【课程】微生物基因组研究生信入门必修课【课程】微生物测序数据和基因组数据上传NCBI实操

看不见的线 2025-04-15 08:32:26 125 0 0
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知识小卡片 | 使用 patchwork 包进行图形组合

课程链接【课程】R语言入门与高通量测序数据实战处理【课程】R语言实战：ggplot2包及扩展包的使用实操

看不见的线 2025-04-11 08:35:09 182 0 0
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知识小卡片 | R语言拆分数据框里的列

课程链接【课程】R语言入门与高通量测序数据实战处理【课程】R语言实战：ggplot2包及扩展包的使用实操

看不见的线 2025-04-11 08:34:03 125 0 0
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知识小卡片 | 耐药研究中的MDR、XDR、PDR-不动杆菌篇

课程链接【课程】微生物抗性与毒力基因注释：ABRicate软件全能实战【课程】肺炎克雷伯菌耐药研究方法及分析思路【课程】铜绿假单胞菌耐药性研究与分析实战

看不见的线 2025-04-07 08:26:46 230 0 0
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知识小卡片 | 耐药研究中的MDR、XDR、PDR-铜绿假单胞菌篇

课程链接【课程】微生物抗性与毒力基因注释：ABRicate软件全能实战【课程】肺炎克雷伯菌耐药研究方法及分析思路【课程】铜绿假单胞菌耐药性研究与分析实战

看不见的线 2025-04-02 08:25:40 330 0 0
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知识小卡片 | 耐药研究中的MDR、XDR、PDR-肠球菌篇

课程链接【课程】微生物抗性与毒力基因注释：ABRicate软件全能实战【课程】肺炎克雷伯菌耐药研究方法及分析思路【课程】铜绿假单胞菌耐药性研究与分析实战

看不见的线 2025-03-31 10:44:08 304 0 0
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知识小卡片 | 耐药研究中的MDR、XDR、PDR-金黄色葡萄球菌篇

课程链接【课程】微生物抗性与毒力基因注释：ABRicate软件全能实战【课程】肺炎克雷伯菌耐药研究方法及分析思路【课程】铜绿假单胞菌耐药性研究与分析实战

看不见的线 2025-03-27 08:29:09 390 0 0
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知识小卡片 | 耐药研究中的MDR、XDR、PDR-肠杆菌篇

课程链接【课程】微生物抗性与毒力基因注释：ABRicate软件全能实战【课程】肺炎克雷伯菌耐药研究方法及分析思路【课程】铜绿假单胞菌耐药性研究与分析实战

看不见的线 2025-03-24 08:27:13 341 0 0
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知识小卡片 | 耐药研究中的MDR、XDR、PDR-详解

课程链接【课程】微生物抗性与毒力基因注释：ABRicate软件全能实战【课程】肺炎克雷伯菌耐药研究方法及分析思路【课程】铜绿假单胞菌耐药性研究与分析实战

看不见的线 2025-03-20 08:20:56 409 0 0
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细菌基因组注释软件Bakta安装、使用和结果解读

随着基因组学研究的深入，细菌基因组注释成为了重要的一步。Bakta（BacterialGenomeAnnotationToolkit）是一款高效的细菌基因组注释软件，它能够自动化完成基因预测、功能注释以及其他相关的生物信息学分析。本文将带您了解Bakta的安装、使用及结果解读。一、

看不见的线 2025-03-18 08:30:01 672 0 0
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知识小卡片 | 假单胞菌的质粒分型

课程链接【课程】可移动元件研究实战指南——从理论机制到分析实操【课程】铜绿假单胞菌基因组研究综合分析实战

看不见的线 2025-03-17 08:19:52 420 0 0
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知识小卡片 | 质粒分型概述

课程链接【课程】可移动元件研究实战指南——从理论机制到分析实操【课程】肺炎克雷伯菌基因组学研究综合指南【课程】铜绿假单胞菌基因组研究综合分析实战

看不见的线 2025-03-14 08:39:41 469 0 0
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细菌耐药大揭秘！你对细菌耐药了解多少？

看不见的线 2025-03-12 09:35:58 482 0 0
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知识小卡片 | RStudio 比较好用的快捷键

课程链接【课程】R语言入门与高通量测序数据实战处理【课程】R语言实战：ggplot2包及扩展包的使用实操

看不见的线 2025-03-10 08:20:55 614 0 0
软件使用
知识小卡片 | ggview—解决RStudio中图形输出与预览不一致

课程链接【课程】R语言入门与高通量测序数据实战处理【课程】R语言实战：ggplot2包及扩展包的使用实操

看不见的线 2025-03-07 08:26:36 570 0 0
软件使用
Easyfig运行问题排查与解决方案：BLAST配置与路径设置的常见问题解析

Easyfig无法正常运行的问题通常与BLAST的配置及路径设置有关。本文将从“BLAST是否能正常使用”，“Easyfig是否能正常调用BLAST”，以及“其他问题”三个方面，详细分析Easyfig无法正常运行的原因，并提供相应的解决方案。注意请优先排除序列本身的问题，每个

看不见的线 2025-03-06 10:00:47 673 0 0
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知识小卡片 | tet基因的分类

看不见的线 2025-03-05 09:12:36 543 0 0
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Easyfig指南-比较基因簇图像的颜色修改

问题：在基因簇比较分析时，研究人员通常需要为不同功能的基因赋予不同的颜色，以更直观地展示基因功能的多样性。然而，基因簇分析工具Easyfig软件默认仅支持为所有基因统一设置颜色，这在很大程度上限制了可视化效果。为此，本文将详细介绍两种实现基因特异

看不见的线 2025-03-04 10:13:27 565 0 0
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知识小卡片-替加环素耐药的可能来源

看不见的线 2025-03-03 09:49:51 539 0 0
软件使用
Easyfig必学锦囊：Genbank文件起始位置调整方法

问题：在基因组分析过程中，我们时常会遇到需要调整GenBank文件序列起始位置的情况。这种需求可能源于两个主要原因：一是原始文件设定的起始位置不够合理（如位于基因编码区内部）；二是基于比较基因组学研究的需求（如进行基因簇比对分析）。示例：如图1所示

看不见的线 2025-02-28 11:50:51 655 0 0

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