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ISCR1与整合子及抗性基因的联系

  • 看不见的线
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  • 2023-11-23 13:50:11
  • 原创

目前累计已发现的ISCR共有29种,按照发现的先后顺序分别命名为ISCR1-ISCR29。其中对于ISCR1的研究最多,也最为深入。ISCR1原名orf513,表示该元件包含513个氨基酸,它最早在In6和In7中发现,其1类整合子结构被认为最初由转座子Tn402衍生而来,反映了转座子和整合子之间的亲密关系。ISCR1是1类整合子3’-CS区复合结构遗传多样性的主要来源,与多种抗性基因密切相关,包括甲氧苄啶类(dfrA23dfrA3bdfrA10dfrA18)、喹诺酮类(qnrAampR)、Class A-β-内酰胺类(blaCTX-MblaVEBblaPER)、Class B-(blaNDMblaIMPblaVIM)、Class C -β-内酰胺类(blaDHAblaCMYblaMOX)以及氨基糖苷类(armA、nbrB)等。

以下结果参考官方命名网站(http://medicine.cf.ac.uk/en/research/research-groups/i3/research/antibacterial-agents/iscr-elements/)。

图1 最早发现ISCR1的In6、In7结构
图2与甲氧苄啶抗性基因相关的ISCR1元件
图3与喹诺酮类抗性基因相关的ISCR1元件
图4与Class A-β-内酰胺类抗性基因相关的ISCR1元件
图5与Class C -β-内酰胺类抗性基因相关的ISCR1元件
图6与氨基糖苷类抗性基因相关的ISCR1元件

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