blaKPC基因相关的转座子结构概述一

已有多项研究表明bla_KPC基因与转座子Tn4401密切相关。

Tn4401属于Unit转座子类型，包含解离酶基因tnpR和转座酶基因tnpA，插入序列ISKpn7、ISKpn6以及碳青霉烯耐药基因bla_KPC。在经典肺炎克雷伯菌ST258中，bla_KPC携带的Tn4401转座子是一种较为常见的结构，但也有其它一些菌株展现出了不同的特征。比如有报道显示Tn4401与Tn1331可以通过同源重组形成新的杂合转座子结构，这种结构并没有改变Tn4401本身，而是将Tn1331的部分基因整合在了Tn4401外侧。

除了Tn1331的这种转变以外，越来越多的研究发现bla_KPC基因的侧翼表现为非Tn4401的转座子特征。2014年Chen等人的一份报告总结了这些非Tn4401转座子的基本结构（NET_KPC结构），并将其分为了NET_KPC-I、II、III三种类型，其中I型和II型可能是由Tn4401转座子演变而来的。I型的bla_KPC上游通常连接着ISKpn27（即图2中的ISKpn8）或Tn2的解离酶tnpR，II型的bla_KPC上游与不完整的Δbla_TEM相邻，且I型和II型的bla_KPC下游都为截短的ΔISKpn6，ΔISKpn6连接着korC、klcA等基因。而III型指的是那些非常规的bla_KPC遗传结构，它们通常与Tn4401、NET_KPC-I、NET_KPC-II完全没有关联，是bla_KPC遗传结构中最特立独行的一类。

2021年Yang等人的报告进一步展示了与NET_KPC-I和NET_KPC-II相关的不同质粒bla_KPC基因上下游的复杂情况，反应了bla_KPC遗传背景的多样化和规律性，从中我们也可以看到在这些NETKPC结构中NET_KPC-Ia和NET_KPC-Ib的衍变最为多样化，也是我们研究中最容易遇到的类型。

但无论如何，由于耐药基因遗传背景的复杂多变性，对于bla_KPC基因的遗传背景仍有待进一步的分析，包括与物种相关的特异性演变，从质粒到染色体的重组嵌合方式等等。

推荐课程

【课程】微生物比较基因组精品系列课——全套自学必入的系统课程

课程链接：微生物比较基因组精品系列课【全套】

【课程】微生物比较基因组与群体进化——基因组变异专题研究

课程链接：微生物比较基因组与群体进化

【课程】微生物分子分型-MLST课程——分型全套（含理论、软件、方法）

课程链接：微生物分子分型-MLST课程

【课程】基因组结构分析神器Easyfig实操精品课

课程链接：基因组结构分析神器Easyfig实操精品课

【课程】BRIG绘图——结构比较专题2

课程链接：走进比较基因组，BRIG软件带你轻松玩绘图

【课程】肺炎克雷伯菌基因组学研究综合指南

课程链接：肺炎克雷伯菌基因组学研究综合指南

【课程】微生物基因组生信必学课程

课程链接：微生物基因组生信分析必学课程

【课程】微生物生防菌研究

课程链接：生防菌的系统化研究

专题材料

【资料】耐药专题材料

【资料】生防专题材料

请添加唯那生物技术客服小唯的微信号winnerbio01，备注“耐药专题”或“生防专题”，立马获取。

更多专题推荐

CORPORATE CULTURE

1、耐药毒力专题

2、EasyFig软件使用指南

3、微生物基因组研究文章

4、微生物分型技术MLST-cgMLST必学要点