blaKPC基因相关的转座子结构概述二

之前我们已经讨论过携带bla_KPC基因的Tn4401以及NET_KPC的三种模式，包括bla_KPC上游为ISKpn27的I型，Δbla_TEM的II型和其它基因的III型（详情参见“bla_KPC相关的转座子结构概述一”）。这次给大家分析的是常见的NET_KPC-Ib的组成。

根据转座子数据库（The Transposon Registry）的记录，已发现与KPC相关的转座子包括Tn4401、Tn6296和Tn6376三种。除了Tn4401以外，Tn6296和Tn6376都是NET_KPC-Ib模式的衍生结构或组成部分。Tn6376指的是bla_KPC上游包括ISKpn27、tnpA、tnpR在内的结构，其中tnpA和tnpR属于Tn3转座子家族。然而完整的Tn3转座子还携带bla_TEM基因，它不存在于NET_KPC-I型结构中，但它的截短基因Δbla_TEM又是NET_KPC-II的典型特征。为了探究NET_KPC-I与NET_KPC-II两者的联系，我们检查了部分携带NET_KPC-II结构的菌株，发现它们的ISKpn27上游也可能含有Tn3的解离酶和被截短的Tn3转座酶，因此有理由怀疑NET_KPC-I和NET_KPC-II这两种形式的分化，可能源于ISKpn27插入导致的Tn3不同程度的丢失。而Tn6296是NET_KPC-Ib的“The core bla_KPC platform”插入到Tn1721的Tn1722内部所形成的，该过程同时也导致Tn1722的mcp基因被截短为非完整结构（关于Tn6296和Tn6376的结构可以参考图1、图2的结果）。

一直以来，通过bla_KPC基因遗传背景的大量深入分析，对于该基因的遗传结构模式已经有了非常好的总结。除了一些非典型的情况以外，大部分已知的结构都能从报道的序列中找到相似的原型。这可能与bla_KPC基因总是存在于Tn4401中，且NET_KPC上下游总是ISKpn27和ISKpn6有关。然而需要注意的是IS26的插入可能会使bla_KPC基因相关的转座子结构产生更加复杂的变化。

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