iTOL模板下载及用途说明

iTOL是一个集在线展示、注释和管理进化树的交互工具，绘图过程中我们可以在iTOL页面随意调整树枝、标签的颜色、形状和字体，也可以通过iTOL提供的注释模板来添加多种类型的样本信息或基因组数据。

如何下载iTOL注释模板？

① 打开iTOL网页（https://itol.embl.de/），在上方的Help中选择“Help pages”，打开如下界面。

② 使用“ctrl+F”输入关键词“example_data”，点击发现的“example_data.zip”链接下载iTOL模板。

如何理解多样化的iTOL注释模板？

在下载的“example_data.zip”包中，除“tree_of_life.tree.txt”为示例树文件以外，其余41项都是注释模板。这些模板中原有的数据（Data部分）与示例树文件的样本或分支对应，因此我们可以在“tree_of_life.tree.txt”的基础上添加这些模板来查看其对应的功能。而实际作图时Data部分需要替换为我们自己的数据。

如下图所示，不同的模板针对于不同的使用场景进行使用，包括分支、标签的样式修改，标签的替换，样本分组信息、基因组数据的添加等等。某些模板含有相同的功能，但它们对数据的格式要求可能不同。对于同一类型的注释，比如添加标签符号的“tol_binary”，添加条带颜色的“tol_color_strip”等等，都含有多个模板，这些模板仅表现为填入数据及参数设置的差异，本质上是相同的模板，择一使用即可。

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