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RNA/DNA序列相互转换

  • 看不见的线
  • 47
  • 2025-06-27 09:57:40
  • 原创

Seqkit2 是 Seqkit 的新版本,是一个专门用于处理和分析生物序列数据的软件工具。它支持多种序列数据格式,包括FASTA、FASTQ等,并提供了一系列有用的功能,如数据处理、过滤、统计、格式转换等,是生物信息学领域中常用的工具之一。以下是使用seqkit实现RNA/DNA序列相互转换。

# 查看RNA序列文件(hairpin.fa)

head hairpin.fa

# 使用 seqkit seq --rna2dna命令将 RNA 转换为DNA

seqkit seq --rna2dna hairpin.fa

# 使用 seqkit seq --dna2rna命令将 DNA 转换为RNA

seqkit seq --dna2rna viral_top100.fasta | head

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